Madara a fondé le village de Konoha avec son ami d'enfance Hashirama, avant de devenir son ennemi. Responsable de l'attaque de Konoha par Kyûbi, il fut vaincu par Hashirama. Il possède le Rinnegan, qu'il transplanta à Nagato pour revenir de la mort.
Principal antagoniste du manga Naruto et chef légendaire du clan Uchiwa, c'est l'un des plus grands shinobis de tous les temps, capable de tenir tête aux 5 kage en même temps.
Au premier abord, on pourrait penser que cet homme alcoolique et amateur de jolies filles n'est qu'un "ermite pervers", premier surnom que lui donne Naruto. Mais Jiraya est en réalité un puissant ninja.
Élève du 3ème Hokage, membre du Trio Légendaire des Sannin avec Tsunade et Orichimaru, il est aussi celui qui a entraîné le 4ème Hokage, père de Naruto. Il devient par la suite le mentor de Naruto et lui apprend le Rasengan et la voie du crapaud.
Personnage attachant et charismatique, il est aussi celui dont la disparition dans le manga a été la plus triste pour les fans.
Selon l'auteur Masashi Kishimoto, Rock Lee a été créé pour symboliser la faiblesse humaine. Mais il est aussi la preuve que la volonté peut tout accomplir. Enfant, son rêve était de devenir un ninja, mais il était incapable d'utiliser son chakra pour maîtriser le ninjutsu et le genjutsu.
Avec l'aide de son sensei Gaï, il se spécialise dans le taijutsu (combat au corps à corps) et devient un redoutable combattant. Surnommé "gros sourcils" par Naruto à cause de son apparence, il a offert aux fans des combats d'anthologie et restera à jamais le premier à avoir mis une raclée à Gaara.
Comme Naruto et Lee, Hinata a toujours eu beaucoup à prouver. Vivant dans l'ombre de son talentueux cousin Neji, qui lui vouait une haine sans borne, elle s'est éprise de Naruto et a hérité de sa ténacité. Faisant preuve de volonté et restant toujours fidèle à son nindo, elle sauvera plusieurs fois la vie de Naruto.
Son dernier acte de bravoure sera fatal à son cousin Neji, qui se sacrifiera pour la sauver. Quelques temps après, elle finira par se marier avec Naruto et ils auront deux enfants, Boruto et Himawari.
Grand frère de Sasuke, Itachi est aussi responsable de la destruction de son clan, raison pour laquelle son petit frère a juré sa mort. Mais la vraie raison de cet acte était la protection du village de Konoha contre un coup d'état du clan Uchiwa.
Il infiltrera par la suite l'Akatsuki pour l'espionner, tout en protégeant son village natal et son frère. Il gardera son secret jusqu'à sa mort de la main de Sasuke, lui offrant le pouvoir d'Amaterasu et la vengeance qu'il désirait tant.
Shikamaru est un personnage aussi complexe qu'intéressant. Doté d'une grande intelligence, il est aussi incroyablement fainéant et préfère généralement rester couché dans l'herbe à regarder le ciel avec son ami Chôji.
Mais c'est aussi un fin stratège qui comble ses lacunes de combattant par une ruse incroyable. Accédant par la suite au grade de général de l'armée pendant la 4e grande guerre ninja, c'est aussi l'un des plus fidèles amis de Naruto, qu'il jura d'accompagner jusqu'à l'accomplissement de son rêve de devenir Hokage.
Tout comme Naruto, Gaara est l'hôte d'un démon et a été rejeté par son village. Portant sur le dos une jarre, il se sert du sable qu'elle contient pour combattre. Persuadé par son passé de n'être qu'une machine à tuer, il apparaît au début sadique et terrifiant.
Mais après sa rencontre avec Naruto, il prend exemple sur lui, décide qu'il veut lui aussi être aimé et accepte son passé. Il deviendra plus tard Kazekage du village de Suna et l'un des personnages les plus importants du manga.
Taciturne et talentueux, Sasuke est l'exact opposé et le rival de Naruto. Après le massacre du clan Uchiwa par son frère Itachi, Sasuke jure se venger. Une grande partie de sa vie sera marquée par la quête de pouvoir, essentielle pour espérer vaincre son grand frère.
Dans la même équipe que Naruto et Sakura, il sera entraîné par Kakashi. Il finira par quitter le village de Konoha pour s'allier avec l'Akatsuki. Après avoir réussi à tuer son frère, il se rendra cependant compte que celui-ci n'avait fait que le protéger pendant toute sa vie. Il décidera finalement de protéger Konoha après un ultime retournement. Il épousera Sakura avec laquelle il aura une fille, Sarada.
Deuxième du classement, Naruto est l'hôte de Kyûbi, le Démon Renard à Neuf Queues. Fils du 4ème Hokage, mort en scellant le démon en lui, il fut rejeté par les habitants de son village du fait de sa nature.
Cachant sa peine par sa bonne humeur, il se noua d'amitié avec de nombreux autres personnages, dont son rival Sasuke, qu'il considère comme son frère. D'abord infantile et farceur, Naruto s'entraînera avec détermination pour finalement accomplir son rêve et devenir Hokage du village de Konoha.
Plus tard, il épousera Hinata Hyûga avec laquelle il aura deux enfants, Boruto et Himawari.
Personnage mystérieux, Kakashi est d'abord le jônin chargé de l'équipe 7, composée de Naruto, Sakura, et Sasuke. Mettant le travail d'équipe avant tout le reste, il possède le même Sharingan que les Uchiwa, ce qui le rend capable de copier les techniques.
Personnage calme et solitaire, il dévoile son dévouement envers ses amis au fur et à mesure, avant de devenir le 6ème Hokage. Plus tard, il accomplira le rêve de Naruto en le nommant Hokage après avoir pris sa retraite.