L'histoire commune prend place dans la région d’Unys, très inspirée de New York, qui mélange paysages urbains et panoramas naturels. Pour commencer, les joueurs ont le choix entre un dresseur, Ludwig, et une dresseuse, Ludvina, puis entre trois Pokémons : Moustillon, Vipélierre et Gruikui.
Pour la première fois dans l'histoire de la licence, le joueur démarre son aventure dans une grande ville, Pavonnay. Surtout, l’histoire est une suite directe des jeux précédents puisqu’elle se déroule deux ans après Blanc et Noir.
Même si le jeu ne date pas d'hier, les graphismes sont assez exécrables et peuvent très vite ternir l'expérience de jeu...